La Federación nació del impulso de tres entidades: la Asociación Empresarial para la Discapacidad (AEDIS, hasta 2013 AFEM), la Asociación Empresarial de Centros Especiales de Empleo de Cocemfe (AECEMCO) y la Asociación Empresarial de Centros Especiales de Empleo de Fundación ONCE (AECEMFO).
FEACEM, en el año 2017 agrupaba a 14 asociaciones empresariales vinculadas al movimiento asociativo de personas con discapacidad, a través de los cuales integra y representa a más de 800 Centros Especiales de Empleo que aglutinan a 46.000 trabajadores con discapacidad
FEACEM representa y defiende los intereses de las asociaciones empresariales que la integran para mejorar el sector de los Centros Especiales de Empleo como fórmula del empleo protegido y de inclusión social. Desde FEACEM se apuesta por un modelo de empleo de calidad acorde con las condiciones generales del mercado de trabajo para las personas con discapacidad.
FEACEM es miembro asociado del CERMI, teniendo un papel especialmente activo en la Comisión de Empleo del CERMI; socio del Foro de la Contratación Pública Responsable y es miembro fundador de la Fundación BEQUAL.